はい、異なります。株式譲渡では売却益がキャピタルゲインとして課税され、事業譲渡では資産ごとに課税関係が発生します。それぞれ税負担が異なるため、事前に専門家に相談することが重要です。
M&Aスキームの選択や支払い方法の工夫、適格要件の活用などで節税が可能です。特に株式譲渡の場合、適格要件を満たせば繰延納税の特例が適用される場合があります。
個人が株式を売却した場合、原則として確定申告が必要です。ただし特定口座(源泉徴収あり)を利用している場合は不要です。法人の場合は必ず申告が必要となります。