株式の譲渡損益は分離課税で申告します。売却益が出た場合は申告分離課税、損失が出た場合は3年間の繰越控除が可能です。e-taxを利用すれば簡単に申告書を作成できます。
自宅を売却して損が出た場合、一定の条件を満たせば損益通算や繰越控除の特例が利用できます。ただし居住用財産に限られるなど条件があるので注意が必要です。
損失を繰り越すと、将来の利益と相殺できますが、特定口座の利用制限や益出しの機会を逃す可能性があります。状況に応じて当年中に損益を相殺する方が有利な場合もあります。