振込手数料を請求側が負担する場合、請求書に明記する必要があります。手数料を別途記載するか、総額に含めるかのどちらかで統一しましょう。インボイス制度では特に記載が重要です。
差し引かれた手数料は「支払手数料」として経費計上できます。ただしインボイス対応では、手数料分も含めた総額で請求書を発行し、実際の入金額との差額を調整する必要があります。
法律上特に規定はなく、契約や取引慣行によります。一般的には依頼者が負担しますが、事前に双方で確認し、請求書や契約書に明記しておくことが重要です。