特定口座は証券会社によって手数料体系が異なりますが、一般口座と比べて取引手数料が安い場合が多いです。ただし、特定口座には源泉徴収あり・なしの2種類があり、手数料以外にも税金面での違いがあります。
特定口座（源泉徴収あり）で売却した場合、利益に対して約20.315%（所得税15.315%＋住民税5%）の税金がかかります。例えば50万円の利益で約3.9万円の税金が発生します。特定口座（源泉徴収なし）の場合は確定申告が必要です。
NISA口座は非課税枠があるため、長期投資には有利です。特定口座は取引回数が多い方や短期売買をする方に向いています。投資スタイルや金額によって最適な口座は異なるため、両方を使い分けるのがおすすめです。
