FXの利益には所得税と住民税がかかります。税率は総合課税で、利益額に応じて5%から45%の累進課税が適用されます。
はい、海外FX口座での取引でも日本国内で課税対象となります。確定申告が必要で、利益を申告しなければなりません。
自動売買システムで得た利益も通常のFX取引と同じく課税対象です。MT4やEAを使った取引でも、利益が出れば確定申告が必要です。