FXの利益は雑所得として総合課税の対象となり、株の利益は譲渡所得として申告分離課税の対象となります。税率や必要経費の扱いが異なるため、確定申告方法も変わります。
FXの損失は3年間繰り越せますが、株の損失は翌年以降に繰り越すことができます。確定申告時に「損失申告書」を提出する必要があります。特定口座を利用している場合でも、損失繰越には別途手続きが必要です。
特定口座(源泉徴収あり)を選べば確定申告が不要になる場合がありますが、損失繰越をしたい場合や経費を計上したい場合は一般口座が適しています。投資スタイルや税金対策によって最適な選択が異なります。