源泉徴収あり口座では、税金が自動的に差し引かれるため、確定申告が不要です。手間が省ける点が最大のメリットです。
NISAは非課税制度のため、長期的な投資にはNISAが有利です。ただし、NISAには投資額の制限があるため、それ以上の投資には源泉徴収あり口座を利用すると良いでしょう。
源泉徴収あり口座でも、年間を通じての損益通算は可能です。ただし、確定申告が必要な場合があるので注意が必要です。