過剰な取引回数や小さな利幅での取引が原因です。特にスキャルピング手法では手数料が利益を上回りやすい傾向があります。
1日の取引回数を制限し、1回あたりの目標利幅を大きく設定すること。また、アルゴ取引の動向を把握し、不利な条件での取引を避けることが重要です。
まずはシミュレーション取引で経験を積み、自分の手法が手数料を考慮しても利益が出るか検証することが大切です。テスタやひろゆき氏の分析動画も参考になります。