特定口座（源泉徴収あり）で株を売却した場合、税金は売却時に自動的に差し引かれます。楽天証券などの証券会社が源泉徴収を行い、売却代金から直接税金が控除されます。
源泉徴収される税金は、売却益（譲渡所得）に対して20.315%（所得税15.315% + 住民税5%）が適用されます。例えば50万円の売却益がある場合、約3.9万円が税金として引かれます。
一部売却の場合も、売却した分の利益に対して同じ税率が適用されます。例えば1万円分を売却して利益が発生した場合、その利益額に応じて税金が計算され、源泉徴収されます。
